Lo que pasa es que la mayoría de los servidores de descarga (por no decir todos) no aceptan contenido, pirata, con copyright, o algo así. . . y si el archivo en cuestion genera varias descargas (y posiblemente puntos al uploader), es posible que alguien quiera revisar el contenido de ese archivo para ver si cumple con las reglas. . . y si ven que el contenido es pirata, lo borran.
Pero debido a que ellos solo tienen almacenado el achivo, pero no saben donde se postea este, junto con su contraseña, si no tiene contraseña, no lo pueden revisar, y por ende es un poco más dificil que lo borren.
También cabe mencionar que aunque le pongas contraseña, si el nombre del archivo es muy obvio (por ejemplo Windows 7 Home Premiun + Keygen.rar) de cualquier manera te lo borran aunque no lo puedan revisar.
En especial Megaupload y Rapidshare tienden a revisar los archivos cuando estos pasan cierto número de descargas.
Saludos!