WTF???
La diferencia principal es que el sistema de 64 bits aprovecha la capacidad de direccionamiento de memoria del procesador. La desventaja que le veo es que no puede ejecutar aplicaciones de 16 bits, o sea, aplicaciones para Windows 3.1...
Si tienes o piensas tener más de 3GB de RAM, necesitarás el de 64 bits o estarías desperdiciando memoria.