la palabra es cifrar. (encriptar es una mala traducción de crypt, es como si dijeras "cuztomizar", "bakupear" en lugar de personalizar y respaldar, suena y se ve horrible)
para cifrar tus datos puedes usar truecrypt un programa multiplataforma, también está gpg, o luks (hay muchas guías en Google)
para las contraseñas depende del entorno que uses, por ejemplo en KDE está kwallet que es un gestor de contraseñas.