Haber si entendi la pregunta, cuando formateas una memoria, se borra toda la informacion (datos virus y demas) pero si la computadora donde lo haces, esta infectada, la memoria se infectara nuevamente, ahora, la parte donde indicas que desaparece la proteccion, se supone que la proteccion te la da el antivirus o el programa que hayas instalado para que no se infecten, el chiste es que ya me hice bolas hasta para responderte pero......
1.- computadora infectada = memorias infectadas (aunque le hagan brujeria, o le pasen un huevo pal susto)
2.- memoria formateada = borrar todititititito lo que tenga, pero caes en el punto 1 y asi visconvesamente proporcional
o si no, yo opino que aclares un poco mas tu pregunta, o me la aclaren a mi.
saludos