Mídelo de acuerdo a tu tiempo. Siempre horas cerradas.
Ejemplo: Yo cobro $120 por mi hora de trabajo. Si el proyecto me llevará 1 hora con 12 minutos, cobraré $240 por el proyecto, sea cual sea el proyecto, se trate del cliente que se trate, dado que tu tiempo es directamente proporcional a la complejidad del proyecto y por lo tanto proporcional a tu bolsillo.