en casos muy extremos cuando no hay OTRA pc para escanear y tampoco puedes respaldar y AHUEVO hay k reinstalar...
uso el hirens boot cd 10.1 ( o cualquiera que tenga mini-XP)
booteo con el mini XP muevo todos los archivos que quiero salvar a una carpeta en la raiz de C:
luego borro TODAS las demas carpetas ( windows, documments and settings etc..)
dentro de WINDOWS\SYSTEM32 posiblemente te marque error moviendo un par de archivos que son del plugin de FLASHplayer... unicamente da click derecho>RESET NTFS PERMISSIONS y das Y en las ventanas de CMD que te salgan
y listo ia puedes borrar TODO ( menos la carpeta del respaldo claro)
apaga la pc e inicia desde el cd de windows pero cuando te pregunte sobre que tipo de formateo vas a hacer utiliza NO FORMATEAR DEJAR EL SISTEMA DE ARCHIVOS INTACTO
de esta manera logras una instalacion "Limpia" pero salvas tus datos...
una vez instalado windows, instala un buen antivirus, y actualizalo ANTES DE ABRIR CUALQUIER COSA DEL RESPALDO) ... esto como medida precautoria
tambien es recomendable que no uses ningun USB k hayas usado en la instalacion infectada, hasta que estes seguro que este este limpio de virus o tu pc este inmunizada contra virus por medio de USBs...
saludos!