en explorador de windows en caso ke uses windows xp ves a herramientas -----> opciones de carpeta --->ver ----> mostrar archivos ocultos y en la parte inferior kitas la opcion de ocultar archivos protegidos del sist. operativo. aceptas ve a tu usb y podras ver tus archivos ocultos.. t recomiendo de respaldes toda tu info y formatees la usb.
otra opcion pa ver los archivos es tener el winrar, abres el programa del winrar y desde ahi abres tu usb y t mostrata todos tus archivos hasta los ke estan ocultos.
en todo caso tendras ke respanldar todo los archivos y formatear para eliminar la infeccion ke alla causado eso...
bueno espero t sirva ... y perdon por tanto choro...
nota: en windows 7 es organizar lo de herramientas