Las unicas partes que se mueven dentro de tu pc son los ventiladores, unidades opticas y discos duros, los ventiladores estan presentes en tu procesador, gabinete, tarjetas de video (solo en algunas), y en la motherboard (solo en algunas).
Asi que abre el gabinete de tu pc, y ponte a escuchar que componente es el que hace ruido.
Si es algun ventilador mas arriba te dejaron la solución.
Pero si es algún disco duro, vete haciendo a la idea que necesitas otro nuevo por que ya esta a punto de morir.
A parte de todo esto, dale una buena soplada a toda tu computadora (por adentro y por afuera), con aire comprimido para quitar el polvo, eso tambien causa los ruidos.
Saludos!