La diferencia esta en el tiempo y la presición, existen códigos que almacenan hasta 30 dígitos o quizás mas y es mucho mas fácil presionar un boton y escanear la infomación que presionar 30 veces el teclado, además te evitas los dedazos o errores causados por la falta de atención al escribir. Existen diferentes códigos de barra, aunque todos parecen iguales no lo son. Existe el 128, el cual puedes dividir en 128A, 128B y 128C (Cada uno con carácteristicas diferentes, por ejemplo uno te escanea todo en minúsculas, otro con todo en mayúsculas y el último solamente números, además algunos solo te permite que sea una cantidad exacta, tambien existe el EAN13, el 3of9, el 2of5 entre otros, cada empresa toma el que mas se ajuste a sus necesidades.
Por ejemplo, existe una empresa llamada Target la cual utiliza el Código 128 y su planta de distribución solamente utiliza Cinturones de transporte y Escaners, los productos de acuerdo al código que traen son distribuidos a diferentes lugares y con esto la empresa se ahorra una buena feria en mano de obra y su presición es de un 99%, la mano de obra que pagan es mínima y si acaso algún código no llegase a leer bien es retirado y puesto aparte para verificación personal. Otro ejemplo es el servicio de Correo (FedEx, UPS, DHL), todos los paquetes traen códigos especialmente el código 2D que es uno de los mas fáciles de leer (El cuadrito con muchos puntitos)...
Los mismos códigos tienen una base de calidad para su lectura, (es como tu escritura, si dicen que tienes letra de doctor es porque seguramente no se entiende (estereotipo) y si tienes letra de molde seguro se ve bonita...) Los códigos de barras se miden en escalas del 0 (malo) al 4 (excelente) o con letras de la A a la F donde A, B y C son grados que se consideran buenos; D y F son considerados malos.
Bueno, creo que ya escribí de más... pero espero que haya quedado despejada tu duda. Yo trabajo en una empresa donde nos dedicamos a crear códigos de barra y vaya que en ocasiones son un dolor de cabeza cuando no obtenemos la cálidad que deseamos.
Saludos!