Talvez un error de computadora...comprueba los errores de tu disco duro para eso vete a:

Mipc/Discodurolocal/clickderecho/propíedades/herramientas.

Pues la verdad el que instale algo Windows al insertar una USB es normal, siempre cuando es una usb diferente, por que si es la misma, supongo que de alguna manera se elimina la configuracion, no sera virus o una errores del registro de windows? por si acaso dale una limpieza de registro de windows con el Registry Mechanic, por aqui en el foro anda y una escaneada con un buen antivirus, si no se soluciona eso, entonces es cuestion de hardaware, creo