para empezar es muy dificil que la misma placa madre sufra un sobrecalentamiento, no asi los chips que integra como el nortbridge u otros dispositivos que ya son conectados "externos"(cpu, gpu, hd,ram).
Para cada uno puedes ponerle sus propiosdisipadores/ventiladores.
O bien asegurarse que existan en el gabinete buena circulacion de aire y tener algunos ventiladores que saquen el aire caliente.
Ya si quiers invertir en un sistema liquido pues puedes hacerlo, pero para mi no vale la pena invertir en algo que con unos buenos ventiladores/disipadores, te dara el mismo resultado y sin gastar tanto.