Si quieres tener tu sistema bien limpio no hay nada como BleachBit.
BleachBit liberará ingente espacio ocupado por archivos obsoletos de todo tipo. Pero no sólo y únicamente de Ubuntu, sino que también limpiará la basura que vayan dejando muchos de los programas que estés utilizando como por ejemplo:

aMsN, Emesene, Firefox, Chrosme, Opera, Screenle, VCL, gPodder, OpenOffice, etc, etc.

Esta herramienta es sumamente fácil de utilizar. Tan solo tienes que ir activando la casillas de lo que quieras limpiar, luego pulsar en Vista Previa, y por último se te interesa en Eliminar.
Como podrás comprobar activando la primera casilla de cada grupo automáticamente se activaran todas la pertenecientes a eses grupo, pero también puedes hacerlo de forma individualizada dentro de cada grupo.
Seleccionando cualquier grupo, a la derecha te mostrará una descripción de cada uno de los apartados.

Algunos ejemplos:

Chrosme

Miniaturas



Second Life

Caché






Cuando selecciones algo que aún no está muy testado, te dará un aviso al respecto.



De todas formas cuando intentes limpiar archivos que puedan repercutir en el sistema no te dejará ...




...y para esto tendrás que abrir el programa con la segunda entrada desde:

Sistema → Administración → BleachBit as Administrator

Como podrás ver hay dos entradas :
BleachBit (para operaciones normales de Usuario, operaciones seguras)
BleachBit as Administrator (para operaciones Root)




Esta utilidad la puedes instalar desde el propio Centro de Software de Ubuntu.
Pero si quieres la última versión, la puedes descargar desde aquí seleccionado tu distribución:

http://bleachbit.sourceforge.net/


​