Ok. tienes varias opciones:
1. Arrancalo en modo seguro, Se comporta igual?
2.-
a.-Mete el dvd de win7/8/10 y despues de elegir el idioma de instalar y presionar siguiente,
b.- En esa ventana selecciona en la parte inferior izquierda: Reparar el Equipo
c.- Te abrira un Menu, elige Linea de Comandos o Simbolo de Sistemas
d.- Una vez ahi, cambiate a C ( c: y das enter) por lo regular C es la letra mas comun asignada donde se instala el sistema.
e.- Verificalo con un DIR y enter, si ves la carpeta user o windows, entonces ese es el del sistema, si no aparecen cambiate a D,E o F
f.- Y una vez que des con el disco del sistema, escribe CHKDSK /R ( depende del tamaño del disco duro es lo que tardara)
3.- Usar un LiveCD, yo uso HirenBootCd, que trae una utilidad para revisar el disco duro.