ocupas un controlador y a la salida para cada color necesitas un transistor para que le mande potencia necesaria a los 50 leds lo que tu quieres hacer es algo como esto:

http://www.facebook.com/media/set/?set=a.10150352564877529.360941.571092528&type=1&l=a9830988df

checa las fotos men, bueno ahi es un controlador ya mas choncho y 2 fuentes de poder ya que son mas de mil leds