NO te recomiendo que cambies la letra de unidad, A MI YA ME PASO y me lleve resultados bastante desagradables, empezando por un 90% de los programas instalados, incluido el fotochop, corel, itunes, sound forge, vegas, etc...
exactamente tenia el mismo inconveniente, la maldita unidad H: era la del SO, use algun programa para particionar y desde ahi cambie la letra de unidad, pero despues no fue booteable, tuve que recurrir a programas que la hicieran booteable, despues de eso, windows se perdía y reiniciaba a cada rato, entonces tuve que recurrir al cd de instalacion para un chkdsk, despues de que pude entrar a mi sesion, wow, un montón de programas tenían errores y todo por que??? en el registro todos estaban dados de alta como H:, entonces era cuestion de cambiar todas las H:\ a C:\, aun asi hubo broncas con drivers, en algunos inf y log existia la maldita unidad H, y pues ya te imaginaras, era cuestion de desisntalarlos y reinstalarlos, PERO NO SE PODIAN DESINSTALAR!
en fin, sigo con pequeños errores pero pasables, yo te recomendaria si tenias otro SO, mejor uses otro disco duro fisico para bootear con otro(s) SO(s), o que mejor te esperes a formatear tu maquina y desde ahi lo hagas como unidad C... o de plano que te prepares con un monton de programas y muchisimo tiempo por que vas a lidiar con el windows y su interminable lista de errores sin arreglos, windows (y creo que ningun sistema operativo) se repara a sí mismo
suerte y espero esto sea de utilidad ñ_ñ