Es necesario Instalar el windows server 2000? porque no pruebas con la edicion de server 2008 enterprise? y ahora si es necesario instalarla la 2000 asegurate que tengas integrado en el disco de instalacion del S.O. el driver AHCI del disco duro lo puedes agregar con el programa nLite. Yo lo...
Puedes utilizar el super grub disk para recuperar el mbr de tu windows o de tu linux o tambien existe un programa llamado easybcd con ese puedes anexar la entrada para el mbr e inicar tu sistema operativo... Ojala te sirva cualquier duda pregunta y te respondere
Entra a la opcion del BIOS en una seccion donde Indica el floppy Ahi Desactivalo dale F10 (para guardar los cambios) y reinicia y listo ya no t pasara lo mismo. asi lo hice con una dell de escritotio que no venia con Floppy